دوره آزمایشگاه علوم ابتدایی در دو گروه دختران و پسران با هدف ارتقاء مهارت های آزمایشگاهی ، استعدادیابی و افزایش اعتماد به نفس با تاکید بر فرآیندهای عملی و کار گروهی و تیمی در این مرکز در حال برگزاری است. این دوره شامل ۱۲ جلسه بوده که در آن ۳ جلسه به آزمایشگاه زیست شناسی ، ۳ جلسه آزمایشگاه فیزیک ، ۳ جلسه آزمایشگاه شیمی ، ۱ جلسه کارگاه کانی شناسی و فسیل ها و ۲ جلسه کارگاه نانوفناوری اختصاص دارد. دانش آموزی که تا کنون در این دوره ها شرکت نکرده اند می توانند به پژوهش سرا مراجعه و پیش ثبت نام نمایند. در پایان این دوره ها پس از برگزاری آزمون مهارتی دانش آموزان از سطح مقدماتی به متوسطه و سپس پیشرفته راه خواهند یافت. ضمناً مدارک و گواهینامه های مهارتی این مرکز به عنوان امتیازی برای ورود به مدارس شاهد و نمونه منظور می گردد.